脊椎動物のゲノム進化

連鎖解析や候補遺伝子法で経済形質に関与する遺伝子を探索する方法は確立されつつありますが、それを実施するには莫大な予算と労力を必要とします。これは群盲、象をなでるのたとえのような状況にあるからです。やや基礎的にはなりますが、脊椎動物のゲノム進化のあり方について、もう少し多くの情報が得られたならば、畜産分野にとってもメリットは大きいでしょう。

研究トピックス

科学技術振興事業団のバイオインフォマチックス推進事業に採択される
マウスの遺伝子数はヒトとほぼ同じ!

これまでの研究成果

世界で初めてクジラとカバに共通な散在性反復配列を発見し、クジラとカバが近縁であることを示しました(Nomura et al. 1998)。また、豚の散在性反復配列PRE-1の分化年代の推定(Yasue and Wada 1996)やマウスゲノム上の重複領域の推定、マウスゲノム上の遺伝子数の推定などを精力的に行っています(Wada et al. 2000, Wada 2001)。

論文

In silico analysis of repeat sequences of pig and cattle genome. Bull. Fac. Agr., Saga Univ. No.91 p.37-43 Wada and Shigemori(2006)
"An exhaustive search for tandem repeats and long duplicated chromosomal regions within the mouse genome", Journal of Animal Genetics 30(1), 3-10, Wada(2002).
"Estimating the number of protein-coding genes of mouse genome", Journal of Animal Genetics 29(1), 17-19, Wada(2001).
"Characterization of a SINE species from vicuna and its distribution in animal species including the family Camelidae" Mammalian Genome, 12:305-308, Lin et al.(2001)
"A SINE species from hippopotamus and its distribution among animal species", Mammalian Genome 9, 550-555 1998. Nomura et al.
"Localization of swine PRE-1 homologues in 13 loci of Phacochoerus aethipicus and Tayassu tajacu genomes, and their sequence divergence", Animal Genetics 28, 210-215 1997. Muladno et al.
"A swine SINE (PRE-1 sequence) distribution in swine-related animal species and its phylogenetic analysis in swine genome", Animal Genetics 27, 95-98 1996. Yasue and Wada

学会発表

「家畜家禽のゲノム領域における反復配列の存在割合と分化パターンについて」、第５０回日本畜産学会大会　講演要旨集、p.213, 2002.
"Estimating the number of mouse genes and the duplicated regions within the mouse genome", Genome Informatics 11, 327-328 Wada et al.(2000)
「マウスゲノム上の重複領域の探索」、第２２回日本分子生物学会年会講演要旨集、2P-1463, 1999.
「ブタ散在性反復配列PRE-1のゲノム内での分布とサイト別突然変異率」、第２０回日本分子生物学会年会講演要旨集、4-J-P-411, 1997.

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最終更新年月日 2002年5月9日